EMBOSS软件包序列分析程序应用实例

本文介绍欧洲分子生物学开放软件包EMBOSS序列分析程序应用实例.第1节简单介绍EMBOSS软件包的概况和基本用法.第2节介绍格式转换、序列提取、序列变换和序列显示等常用序列处理程序.第3节介绍序列比对程序,包括双序列比对、多序列比对和点阵图程序.第4节介绍常用核酸序列分析程序,可用于核苷酸组分统计、开放读码框分析、CpG岛识别、密码子使用统计和重复序列寻找等.第5节介绍常用蛋白质序列分析程序,包括氨基酸组分统计、序列特征位点识别、二级结构分析等.文中结合教学实例,选择部分常用程序,给出具体运行方式,并扼要说明分析结果的生物学意义.文末对程序运行过程中需要注意的地方加以讨论,并用表格列出部分常用程序的名称和用途,以便读者查阅.