基于网络药理学和分子对接的清瘟解毒丸治疗新冠肺炎潜在机制研究

Lishizhen Medicine and Materia Medica Research(2021)

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摘要
目的 基于网络药理学和分子对接方法探讨清瘟解毒丸治疗新冠肺炎的潜在分子机制.方法 使用TCMATCOV V1.0数据库,获得清瘟解毒丸中的活性化合物和潜在治疗靶点;运用R软件进行GO与KEGG通路分析;利用Cyto-scape3.6.1软件构建化合物-靶点网络、药物-化合物-靶点-通路网络;利用AutoDock软件对重要化合物与核心靶点进行分子对接预测.结果 化合物-靶点网络包含95个化合物和相应潜在治疗靶点24个,关键靶点涉TNF、IL10、CCL2、IL2.GO功能富集分析得到GO条目总计366条(P≤0.01),其中生物过程(BP)条目206条,分子功能(MF)条目85条,细胞组成(CC)条目75条.KEGG通路富集筛选得到9条信号通路(P≤0.05),包括细胞因子与细胞因子受体的相互作用(Cytokine-cytokine receptor interaction),病毒蛋白与细胞因子和细胞因子受体的相互作用(Viral protein interaction with cytokine and cytokine receptor),JAK-STAT信号通路(JAK-STAT signaling pathway),C型凝集素受体信号通路(C-type lectin receptor signaling pathway),趋化因子信号通路(Chemokine signaling pathway),Toll样受体信号通路(Toll-like recep-tor signaling pathway)等.提示清瘟解毒丸可能作用于多条炎症、免疫、病毒感染相关通路,发挥治疗COVID-19的作用.分子对接结果显示花生四烯酸、百里香酚与IL-6、CCL2、TNF、IL-10、SARS-CoV-23CL水解酶、ACE2均有较好的结合力.结论 通过网络药理学初步探究了清瘟解毒丸多成分、多靶点、多通路治疗新冠肺炎的作用机制.
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