高通量基因测序仪行业标准的验证

目的 按照制定的高通量基因测序仪行业标准的性能指标,使用测序通量<20 Gb/run且≥2 Gb/run高通量基因测序仪进行验证.方法 取测序仪性能评价用脱氧核糖核酸国家参考品的DNA,经过DNA片段化处理、末端修复、接头连接和文库扩增等步骤后构建文库;然后将文库PCR扩增;最后使用测序反应通用试剂盒(半导体法)和BES4000基因测序仪进行测序.结果 测序覆盖率为99.99％,测序平均深度为166×.国家参考品中人基因组DNA样本的比对率为86.14％,碱基测序准确率为98.97％;SNP、Indel准确率为95.40％;SNP、Indel灵敏度为85.75％.人基因组DNA、人乳头瘤病毒11型基因组DNA、大肠杆菌基因组DNA和高GC含量细菌基因组DNA样本的一致序列准确率分别为99.94％、100％、99.95％和99.88％.国家参考品进行三次重复测序,重复性结果均符合要求.结论 制定的行业标准可以用于高通量基因测序仪的性能评价,为产品注册检定及上市后监督管理提供依据.