基于基质辅助激光解析电离飞行时间质谱的B组链球菌血清型预测模型验证

Chinese Journal of Biomedical Engineering(2021)

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摘要
目的:验证基于基质辅助激光解析电离飞行时间质谱(MALDI-TOF MS)技术的B组链球菌(Group B streptococcus,GBS)在线血清型预测模型的分型效能,为临床GBS菌血清型快速分型提供参考。 方法:选取2015至2018年全国多中心新生儿侵袭感染分离GBS菌237株,均已经应用血清凝集试验结合PCR法确认血清型和多重PCR法多位点序列分型(MLST),包括Ⅰa型18株、Ⅰb型70株、Ⅲ型140株、Ⅴ型8株、Ⅵ型1株。运用乙醇灭活-甲酸(乙腈)提取法提取蛋白,用微生物质谱仪采集蛋白指纹图谱,将图谱以m/z和峰强度数据格式输入GBSTyper,以传统血清凝集法血清型为金标准,采用召回率、精确率、 F值(精确率和召回率的调和平均值)来评价GBSTyper分型效果。 结果:GBSTyper对120株(50.63%)GBS菌血清型分型正确,各血清型召回率从高到低依次为Ⅲ型(71.43%)、Ⅴ型(37.50%)、Ⅰb型(21.43%)、Ⅰa型(11.11%),Ⅲ型精确率最高(86.96%),血清型分型精确率仅为3.57%~46.88%,Ⅲ型 F值最高(78.43%),Ⅰa、Ⅰb、Ⅴ型等 F值仅为6.52%~29.41%。 结论:GBSTyper血清型快速分型模型对Ⅲ型血清型菌株分型有效性较高,而对Ⅰa、Ⅰb、Ⅴ型分型有效性很低。该模型能快速识别高危Ⅲ型GBS,对于围产期新生儿GBS感染预防及患儿的临床管理有重要指导意义。
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关键词
Streptococcus agalactiae ,Spectrometry, mass, matrix-assisted laser desorption ionization,Peptide peak,Prediction model
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