雌激素受体阳性乳癌lncRNA的差异性表达研究

目的 基于生物信息学技术,筛选与雌激素受体(ER)阳性乳癌相关的长链非编码RNA(lncRNA),并初步探讨其与病人预后的关系.方法 通过基因芯片技术,对4对手术切除的ER阳性乳癌组织及其癌旁正常组织进行lncRNA和mRNA的表达谱分析,并对差异表达的mRNA进行GO功能注释、KEGG通路富集分析及疾病富集分析;应用qRT-PCR方法对差异表达的lncRNA在40对ER阳性乳癌组织及癌旁组织中进行验证,同时在ER阳性乳癌细胞株MCF-7及正常乳腺上皮细胞MCF-10A做进一步验证;最后通过TCGA数据库对lncRNA在ER阳性乳癌组织中的表达水平进行分组,使用Kaplan-Meier生存曲线分析其表达量与预后的关系.结果 基因芯片技术分析显示,在ER阳性乳癌组织及其癌旁正常组织共筛选出具有差异性表达的mRNA 3949个、lncRNA 4050个.选取其中差异表达最显著的7个lncRNA在组织中做进一步验证,发现LINC01614(t=10.380,P<0.01)、AC044784.1(t=3.490,P<0.01)、CTD-2510F5.4(t=3.235,P<0.01)在乳癌组织高表达;细胞学验证结果显示,LINC01614(t=3.714,P<0.05)、AC044784.1(t=5.827,P<0.01)、CTD-2510F5.4(t=4.415,P<0.05)在乳癌细胞株中同样高表达.TCGA数据库预后分析显示,纳入的791例ER阳性乳癌病人中,LINC01614高表达者预后相对更差(χ2=7.50,P<0.01).结论 LINC01614在ER阳性乳癌中高表达可能与乳癌的发生、发展及预后相关,可能成为乳癌治疗新的作用靶点.