基于网络药理学和分子对接技术分析白屈菜红碱抗乳腺癌的作用机制

Journal of Xi'an Jiaotong University(Medical Sciences)(2021)

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摘要
目的 利用网络药理学和分子对接技术研究白屈菜红碱抗乳腺癌的作用机制.方法 通过Swiss Target Pretion数据库预测白屈菜红碱作用的靶点集,Mala Cards数据库收集乳腺癌的相关靶点集,取疾病与药物的靶点交集作为白屈菜红碱抗乳腺癌的潜在作用靶点;应用STRING数据库构建靶点蛋白相互作用网络(PPI),并进行拓扑网络分析得到白屈菜红碱抗乳腺癌的核心靶基因;通过Metascape数据库进行基因本体论功能(GO)和京都基因与基因组百科全书通路(KEGG)富集分析;使用Kaplan-Meier Plotter数据库分析核心靶基因的表达与乳腺癌生存期的相关性;借助AutoDock Vina将核心靶基因与白屈菜红碱进行分子对接.结果 通过靶点交集获得白屈菜红碱抗乳腺癌的靶点37个,随后经过拓扑分析得到关键靶点8个;GO富集涉及317个条目;KEGG通路富集分析得到80个条目,主要涉及PI3K/AKT信号通路、VEGF信号通路、ErbB信号通路等;生存期分析结果显示,CHEK1、PIK3CA、mTOR和PTGS2基因的表达量与乳腺癌患者的生存期具有相关性;分子对接结果显示,白屈菜红碱与关键靶点具有较好的结合活性.结论 白屈菜红碱可能通过PI3K/AKT信号通路发挥抗乳腺癌的作用,并具有发展成为乳腺癌临床用药的潜力.
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