橡胶树前纤维蛋白(profilin)基因家族的鉴定及表达分析

李德军,邓治

Chinese Journal of Tropical Crops(2021)

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摘要
肌动蛋白细胞骨架可能在橡胶树乳管伤口堵塞过程中发挥重要作用.前纤维蛋白(profilin)是肌动蛋白动态平衡的重要调节子,但对橡胶树profilin基因家族系统研究的报道较少.通过分析橡胶树基因组和转录组数据,鉴定到6个橡胶树profilin基因,对其基本特性及蛋白保守基序、结构特征、进化关系和表达模式等进行分析.基因结构分析表明,橡胶树profilin基因都包含3个外显子2个内含子,编码的蛋白序列含有profilin蛋白特有的保守基序KYMVIQGE和VIRGKKG.进化分析显示,橡胶树profilin并未严格分为营养型和生殖型2种类型.profilin蛋白二级结构以无规则卷曲为主,三级结构均包含3个α螺旋和7个β折叠.表达分析结果显示,4个profilin基因在胶乳中高表达,橡胶树排胶和碘化钾处理调控这4个profilin基因表达,推测profilin基因参与橡胶树排胶过程.该研究结果为进一步阐明橡胶树profilin基因在乳管伤口堵塞和排胶中的作用奠定基础.
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