普通小麦籽粒硬度的全基因组关联分析

籽粒硬度是小麦品质评价的重要指标.为挖掘控制小麦籽粒硬度的重要基因/位点,以国内外171个小麦品种组成的 自然群体为材料,在4个环境下利用小麦90K SNP芯片对籽粒硬度进行全基因组关联分析(genome-wide association study,GWAS).171个小麦品种籽粒硬度变异系数为56.59％～66.80％,相关系数为0.88～0.92.GWAS结果表明,共检测到20个与小麦籽粒硬度显著相关的SNPs,其中,14个SNPs(7个位点)在2个及以上环境中能被检测到,分别位于1A、1B、1D、2A、5A和7A染色体上,可解释6.76％～11.79％的表型变异.表型贡献率超过10％的SNPs有4个(3个位点),分布在1D、2A和5A染色体上,其中,1D染色体上的标记wsnp_Ku_c19622_29138795在3个环境中能被检测到,可解释9.08％～11.79％的表型变异;2A染色体上的标记Excalibur_c12675_1789在4个环境中均能被检测到,可解释9.10％～10.86％的表型变异;5A染色体上的标记wsnp_Ra_c24707_34262900和BS00041219_51在2个环境中能被检测到,可解释6.76％～10.35％的表型变异.在所有环境下均与小麦籽粒硬度显著相关的位点有4个,分别位于1A、1B、2A和7A染色体上.