基于级联区域卷积神经网络算法在肾组织病理切片中对肾小球的识别与定位

Academic Journal of Second Military Medical University(2021)

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摘要
目的 基于级联区域卷积神经网络(cascade R-CNN)算法开发一种能自动识别肾组织病理切片图像中肾小球的人工智能(AI)系统,帮助病理医师提高计算肾小球个数与识别肾小球的效率.方法 收集2017-2019年3年内在山西医科大学第二医院和山西医科大学附属人民医院行肾穿刺活检术患者的肾脏病理切片,剔除模糊不清、染色质量差的图像,最终得到1 180张质量无明显差异的六胺银(PASM)染色图像.通过高分辨率全视野数字切片(WSI)获得数字化扫描图像,图像数据通过远程病理系统传输到云端并储存.使用cascade R-CNN方法创建训练集(940张图像)和测试集(240张图像),训练集用于训练AI学习识别肾小球,测试集用于测试和评价cascade R-CNN算法识别出肾小球的精确度和召回率.将测试集的病理切片由3名工作年限至少3年的病理医师阅读,计算医师们识别肾小球的精确度与时间.结果 基于cascade R-CNN网络训练完成的深度学习模型识别每张图像肾小球区域时间为(0.20±0.02)s.精确度、召回率分别为93.90%、98.00%,F1值为95.91%.3名病理医师识别每张图像肾小球区域时间分别为(3.57±0.05)、(4.57±0.07)、(3.98±0.02)s,精确度分别为88.08%、89.69%、89.98%,差异均无统计学意义(P均>0.05).cascade R-CNN算法识别肾小球的精确度高于3名病理医师的平均精确度(89.25%),差异有统计学意义(t=-5.607,P=0.009).结论 cascade R-CNN算法通过高分辨率WSI可快速有效地识别肾小球,能够帮助病理医师提高肾脏疾病的诊断效率.
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