利用生物信息方法寻找与绵羊脂代谢相关的候选基因

本实验旨在利用生物信息方法寻找与绵羊脂代谢相关的候选基因并通过实时荧光定量以及Western Blot方法进行验证.利用NCBI网站中的公共测序数据找到3个与脂代谢相关的测序数据,每个测序数据取前250个差异表达基因作为备选结果,然后将3组数据中共有的差异表达基因作为研究对象,实时荧光定量PCR检测此基因在不同绵羊个体脂肪组织中的表达差异以及在同一只绵羊不同组织中的表达趋势,并检测基因在脂肪细胞分化过程中的表达规律.结果显示:3组脂代谢相关的公共数据有1个共有基因,即富含半胱氨酸酸性分泌蛋白类似物1(Secreted Protein Acidic and Rich in Cysteine Like 1,SPARCL1).SPARCL1基因在绵羊脂肪组织中显著表达,在不同个体脂肪组织中的表达量存在显著差异,在绵羊脂肪细胞分化前后SPARCL1基因出现差异表达.综上,SPARCL1基因可能是参与绵羊脂肪代谢的重要基因,其具体功能及作用机制需要进一步探究.