苜蓿属不同物种叶绿体基因组结构比较及亲缘关系分析

以苜蓿属24个种1个亚种叶绿体基因组为研究对象,利用REPuter、mVISTA和MAFFT等分析叶绿体基因组的重复序列、序列变异情况及进化关系.结果 表明,苜蓿属不同种间叶绿体基因组介于121313～132269bp之间,编码110～118个基因,基因数目的 差异主要是因蛋白编码基因数目不一所致.在苜蓿叶绿体基因组中共检测出49～59个重复序列,鉴定出139～163个SSR位点且单碱基重复居多数.序列多样性比对表明,非编码序列在各物种间的差异性较大.此外,筛选到2个核苷酸多样性较高的基因,即clpP和ycf1.通过Maximum likelihood (ML)构建的系统发育树表明,Medicago edgeworthii(毛荚苜蓿)、Medicago archiducis-nicolai(青海苜蓿)和Medicago ruthenica(扁蓿豆)亲缘关系较近.