2017-2020年我国部分地区PRRSV流行毒株变异情况分析

为了解猪繁殖与呼吸综合征病毒(PRRSV)流行毒株的遗传变异情况,本研究对采集自上海市、浙江省、江苏省等地区的566份临床样品进行RT-PCR检测,结果显示,其中246份样品呈现PRRSV阳性.对31株Nsp2基因、21株ORF5基因和12株Nsp9基因进行序列测定和比对分析,发现不同地区流行的PRRSV其Nsp2基因片段大小存在明显差异,大部分毒株保持了HP-PRRSV类毒株Nsp2基因"1+29 aa"缺失模式,同时,检测到"111+5+1+19 aa"和"1+29+14 aa"两种新的氨基酸缺失模式.ORF5基因主要分布在谱系L8、L3和L1中,氨基酸突变主要位于GP5的信号肽区域和高变区,部分毒株在中和性抗原表位区域存在L39/I39的氨基酸突变,有1株存在H38L39/Y38S39的氨基酸突,另外,部分毒株在毒力相关位点出现了R13/Q13和R151/K151的氨基酸突变,而Nsp9与毒力相关的氨基酸位点则相对保守.本研究表明上述发病猪场中流行的PRRS毒株复杂多样,其中HP-PRRSV类毒株和NADC30类毒株仍然是主要流行毒株,养猪场有必要持续监测PRRSV流行毒株的变异动态,为PRRS的科学防控提供参考依据.