云南省野猪源猪瘟病毒E2及5'NTR基因序列测定分析

猪瘟(CSF)是由猪瘟病毒(CSFV)感染猪引起的一种急性、热性、接触性传染病,严重危害我国养猪业健康稳定发展.本研究采用RT-PCR方法,对从云南省宁洱县2头病死野猪体内分离到的2株CSFV毒株进行了E2及5'NTR基因扩增、克隆及序列测定;采用DNAMAN、MEGA6等分子生物学软件,对测得的序列与国内外参考毒株进行了同源性分析及系统发育分析.结果显示:2株野猪源CSFV株E2、5'NTR基因同源性分别为87.2％、100％,与国内外参考毒株同源性分别为81.0％～97.6％、93.6％～98.5％,与我国强毒株Shimen株的同源性分别为81.0％～81.2％、95.6％;2株野猪源CSFV毒株E2基因属于基因2.1亚型,5'NTR基因属于基因2.3亚型.氨基酸序列分析显示:其中一株分离毒株的E2基因有6个氨基酸具有2.1d分子变异特征,另一株兼有2.1d和2.1b亚型分支特征,可能是2.1b和2.1d亚型的过渡毒株.结果表明,云南省野猪源CSFV虽存在一定的遗传衍化,但总体比较稳定.本研究为云南省CSF防控提供了分子流行病学依据,为进一步做好分子变异等研究奠定了基础.