新疆两个地方绵羊品种策勒黑羊、吐鲁番黑羊的基因组选择信号分析

刘玲玲, 刘武军, 马海玉,蒋芳芳, 曹行, 张小洪, 王琼

wf(2021)

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摘要
试验旨在筛选新疆2个地方绵羊品种在长期自然选择和人工选择过程中受到强烈选择的繁殖性状及脂肪沉积相关候选基因,为绵羊重要经济性状的分子选育奠定基础.对策勒黑羊、吐鲁番黑羊进行全基因组重测序,应用选择信号检测(Fst、Pi),分别在策勒黑羊、吐鲁番黑羊基因组鉴定到受选择的128252个SNPs和128396个SNPs,求交集后进行基因注释,获得63个候选基因,其中与绵羊繁殖相关基因15个(BCL2L11、DDRGK1、AMH、UBE2B、TBX3等);脂肪代谢相关基因8个(IRX3、HOXC10、PNPLA7、PLA2G10等).这些基因主要富集在视黄醇代谢、TGF-β信号通路、cAMP信号通路、PI3K-Akt信号通路、抗EGFR酪氨酸激酶抑制剂通路等.以上发现为掌握策勒黑羊、吐鲁番黑羊高繁殖力、脂肪沉积等重要经济性状相关功能基因研究及其种质资源保护和利用提供参考依据.
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关键词
Fst,Pi
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