2017-2019年四川部分地区PRRSV ORF5基因的遗传演化分析

为了解2017-2019年四川地区猪繁殖与呼吸综合征病毒(PRRSV)的流行情况,对收集的47份PRRSV阳性样品进行ORF5基因的扩增、测序,应用DNASTAR和MEGA软件对核苷酸序列及其推导的氨基酸序列进行同源性和遗传演化分析.结果 显示,47条ORF5序列之间的核苷酸同源性为84.2％～100.0％,与PRRSV原始毒株LV和VR-2332的核苷酸同源性分别为60.7％～ 64.6％、84.9％～99.3％,表明分离毒株均属于PRRSV2.对其中35个ORF5基因序列进行遗传演化分析,结果发现,四川地区PRRSV的流行主要以谱系1、5和8为主,各占比34.3％(12/35)、37.1％ (13/35)和28.6％(10/35).此外,氨基酸分析显示,11个分离株的ORF5基因在第34位存在1个氨基酸的缺失,占比31.4％(11/35),特别是该11个缺失分离株均属于谱系1,表明该缺失可能存在毒株特异性.本试验丰富了四川地区PRRSV的流行病学数据,为该地区猪繁殖与呼吸综合征的防控提供了科学依据.