冠心病不同进展阶段差异表达基因筛选

目的 基于转录组学分析不同进程冠心病患者差异表达基因图谱,探索与冠心病进展相关的特异性基因.方法 经冠脉造影与血样质控,选择8例冠脉临界病变患者(临界组),并根据性别、年龄匹配冠脉造影正常者8例(对照组),急性心肌梗死患者8例(心梗组),通过Illumina平台的HiSeq高通量测序技术对不同组别患者外周血单核细胞基因组测序,筛选差异表达基因(differentially expressed genes,DEGs),并进行GO条目富集分析差异基因功能.结果 临界组与对照组相比,有169个DEGs,110个上调和59个下调(基因集1);心梗组与临界组相比,有376个DEGs,246个上调和130个下调(基因集2).最显著富集的GO条目包括炎症反应及mRNA稳定性调节、蛋白结合、细胞核浆及分泌颗粒等条目.基因集1、2交集基因包括DKK3、NR4A1、HIP1和PAX8-AS1.结论 本研究初步获取了不同进程冠心病患者差异表达基因图谱,发现DKK3、NR4A1、H1P1和PAX8-AS1基因表达改变可能与冠心病进展相关.