利用转录组学分析三峡肽素生物合成的基因簇
Science and Technology of Food Industry（2021）
摘要
为了分析三峡肽素(Sanxiapeptin)生物合成途径,本文采用BGISEQ-500平台测定了SG-4在200 mL培养4、7 d及300 mL培养7 d时cDNA文库,并对高通量测序产生的6.42 Gb序列数据进行了无参转录组分析.结果表明,转录组序列比对率高达93.88％,差异基因主要集中在抗生素合成、物质转运及氧化还原代谢等途径,在非核糖体肽合成酶(NRPS,Non-ribosomal peptide synthetase)基因簇PDE_01071中,21个基因的表达趋势与物质的含量完全吻合,暗示其可能参与了三峡肽素的合成.
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