Intérêt d’un panel de gènes de paraparésies spastiques héréditaires

Introduction Des variants dans un nombre croissant de genes sont impliques dans les paraparesies spastiques hereditaires (PSH). Le sequencage haut debit de panels multi-genes permet leur etude ciblee en un temps. Objectifs Cette etude avait pour objectif de decrire le taux de resolution diagnostique et la distribution des genes causaux identifies avec notre panel de genes. Patients et methodes Les resultats des cas index PSH testes entre decembre 2013 et juillet 2019 avec le panel de genes developpe a l’institut du cerveau et utilise a l’hopital de la Pitie-Salpetriere (Paris, France) ont ete recuperes. La version initiale du panel couvrait 65 genes. Le caractere causal des variants etait determine suivant les criteres ACMG et leur presence confirmee par une deuxieme analyse ciblee (Sanger ou MLPA). Resultats Le gene causal a ete identifie chez 472/1550 patients (30,5 %) parmi 35 des 65 genes analyses. Un variant supplementaire a ete identifie avec l’ajout de 7 genes pour les 373 derniers patients testes. Les genes les plus frequemment retrouves etaient de transmission autosomique dominante (60,4 %) avec SPAST (9,1 % des patients), KIF1A (2,2 %) et ATL1 (2,2 %) et recessive (39,4 %) avec SPG7 (4,8 %) et SPG11 (1,7 %). Les variants structuraux representaient 6,0 % des variants pathogenes (1,9 % des patients). Discussion Il s’agit de la plus grande serie validant les performances diagnostiques courantes d’un panel de genes dans les PSH. L’etude d’un grand nombre de genes en une analyse facilite la mise en evidence de genes rares et varies. La couverture de sequencage optimisee permettait la detection de variants structuraux, critique en raison de leur proportion non negligeable. Conclusion Les panels sont performants comme premiere exploration genetique des PSH. La connaissance de la repartition des genes causaux va permettre de renforcer la recherche sur les formes affectant le plus grand nombre de patients.