Detection of Spiroplasma citri from citrus trees in Turkey by molecular techniques

Spiroplasma citri, kurak ve yari kurak iklimde turuncgiller uzerindeki turuncgil palamutlasma hastaligi (Citrus Stubborn Disease (CSD))’na neden olan bir etmendir. Bu etmenin turuncgil bahceleri ve fidanliklarda bulunan genc fidanlardaki enfeksiyonunun erken asamada tespiti ve karakterizasyonu, hastaligin Spiroplasma citri’den ari bolgelere yayilmasini onlemek icin buyuk onem tasimaktadir. Bu calisma, Turkiye\u0027deki farkli Spiroplasma citri suslarinin muhtemel varligini arastirmak amaciyla yapilmistir. Eylul ayinda Adana ilinin Kozan ilcesinde farkli koylerde bulunan turuncgil bahcelerindeki Stubborn hastaligina benzer cogunlukla bogum arasi kisalma, yapraklarda kasiklanma ve leke, sezon disi ciceklenme ve tipik kucuk palamut tipi meyve simptomlari gosteren agaclardan yaprak ve meyve ornegi toplanmistir. Turk izolatlarinin saptanmasi ve karakterizasyonu icin, polimeraz zincir reaksiyonu (PZR) Spiralin-f/r, P89-r/f ve P58-6f/4r primer ciftleri kullanilarak gerceklestirilmistir. Spiralin-f/r primerlerinde pozitif sonuc saptanmamistir. Buna karsin, testlenen tum ornekler P89-r/f ve P58-6f/4r primer ciftlerine pozitif sonuc vermistir. P89-r/f primer ciftinden elde edilen PZR urunleri sekanslanmis ve filogenetik agac olusturulmustur. Elde edilen filogenetik agac, onemli bir turuncgil uretim merkezi olan Adana ilindeki turuncgil agaclarinda saptanan Spiroplasma citri izolatlarinin, Fas, Misir ve Amerika Birlesik Devletleri (ABD)\u0027nden izole olanlardan daha ziyade Meksika, Ispanyol, Cezayir ve Italyan izolatlariyla yakindan iliskili oldugunu kanitlamistir.