利用GSS高通量测序技术分析不同生境下霍山石斛内生真菌群落的分布

Journal of Anhui University of Chinese Medicine(2018)

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摘要
目的 研究不同地域及不同生长环境下霍山石斛内生真菌群落的分布特征.方法 采用DNA分子标定技术确定不同霍山石斛样本的属种,利用GSS高通量测序技术分析霍山石斛样本内生真菌的种类.结果 供试的所有来源的霍山石斛样本均为Dendrobium huoshanense.从10个霍山石斛样本(编号LP1、LP2、LD1、LD2、LS1、LS2、HP1、HP2、JP1、JP2)中分别获得OTU数540、390、405、376、121、601、423、426、392、394个,通过分析每个OTU对应的物种分类信息,这些霍山石斛样本的内生真菌群落分布可归属至种水平,且分别包含内生真菌140、110、134、128、133、142、144、127、151、135种;样本LP1和LP2共有的OTU在物种水平上占84.22%,LD1和LD2共有的OTU在物种水平上占95.58%,LS1和LS2共有的OTU在物种水平上占94.52%,HP1和HP2共有的OTU在物种水平上占93.59%,JP1和JP2共有的OTU在物种水平上占94.05%.结论 不同地域及不同生长环境下霍山石斛(Dendrobium huoshanense)的内生真菌种类存在着差异性,相同地域及相同生长环境下霍山石斛(Dendrobium huoshanense)的内生真菌群落组成基本相同,霍山石斛(Dendrobium huoshanense)内生真菌的生长存在着地域专属性.
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