大豆PEBP基因家族的初步分析

Journal of Plant Genetic Resources(2015)

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摘要
磷脂酰乙醇胺结合蛋白(PEBP,phosphatidyl ethanolamine-binding protein)基因家族在动物、植物和微生物中广泛存在,在控制植物开花和种子休眠中起重要作用.本研究对大豆PEBP基因家族进行了分析,发现了27个大豆PEBP基因的候选序列,其中16个具有完整PEBP结构域的全长序列被认为是大豆CmPEBP家族基因.GmPEBP基因分布在9条染色体上,基因结构高度保守.通过系统发生分析,可将大豆GmPEBP基因家族成员分为FT-like、TFL1-like和MFT-like 3个亚族,并且发现GmPEBP家族成员数目按照大豆物种特异性的方式进行了扩张.对重复基因的Ks分析表明,绝大多数重复基因主要由5900万年前和1300万年前的大豆基因组复制所致.
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关键词
phylogenetic analysis, PEBP gene family ,soybean
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