棉花逆境应答GhWRKY2基因的结构与功能预测

WRKY是一类与植物抗逆相关的转录因子,通过激活下游一系列抗逆应答基因的表达而提高植株的综合抗性.本研究通过基因芯片从陆地棉(Gossy piumh irsutum)中筛选出一个逆境诱导WRKY转录因子基因Gh WRKY2,属于Ⅱ亚组.采用RT-PCR技术获得Gh WRKY2基因cDNA全长,并对其进行序列分析及结构功能预测.根据GhWRKY2蛋白序列进行同源性搜索,得到与GhWRKY2蛋白序列相似度较高的其他物种的蛋白序列,使用MEGA7软件对GhWRKY2蛋白序列及其同源序列进行多序列比对分析并构建同源物种间系统进化树.利用在线工具ProtParam和Motif scan对Gh WRKY2进行氨基酸理化性质分析;利用SMART在线工具进行蛋白序列分析;利用SWISS-MODEL在线工具分别对Gh WRKY2基因结构和三级结构进行分析.结果表明,Gh WRKY2核苷酸序列ORF为942 bp,编码313个氨基酸,预测蛋白分子量为34.22 kD,等电点为8.76.在拟南芥原生质体中,GhWRKY2定位于细胞核内,且具有转录激活活性.逆境应答Gh WRKY2基因的克隆,为进一步从分子水平上验证其抗逆生物学功能以及揭示棉花非生物胁迫抗逆机制奠定基础,并为棉花抗逆育种提供新的候选基因.