水稻PAL基因的全基因组分析及胁迫表达研究

苯丙氨酸酶 (phenylalanine enzyme, PAL) 是催化苯丙烷次级代谢过程中的重要限速酶, 对植物生长发育意义重大.为进一步探讨水稻OsPAL基因的功能, 利用生物信息学的方法, 在水稻全基因组水平上对OsPAL基因家族进行了进化树、基因结构、染色体定位等方面的分析.数据表明, 水稻基因组中共存在9个PAL基因, 命名为OsPAL1Os PAL9, 编码681～719个氨基酸, 都含有一个保守性很高的Lyase aromatic结构域, 集中分布于第2、4、5、11和12号染色体上.进化树的分析表明, 9个Os PAL基因可分为三类亚家族:Ⅰ类 (Os PAL2-4, OsPAL6-7), Ⅱ类 (OsPAL8-9) 和Ⅲ类 (OsPAL1, OsPAL5), 3类比较明显的区别是蛋白N端的前30个氨基酸.荧光定量q RT-PCR分析表明, 除Os PAL8外, 其它8个基因的表达至少受干旱、低温、Na Cl和ABA等4种胁迫中的一种响应.