福建省14株PRRSV-2全基因组特性分析

Chinese Journal of Preventive Veterinary Medicine(2019)

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摘要
为了解福建省PRRSV的流行情况及分子特征,本研究选取14株不同年份不同谱系的PRRSV-2(lineage 3、lineage 8.7、lineage 5.1和lineage 1)进行全基因组扩增并测序分析.结果 显示,福建省14株PRRSV-2基因组全长为15016 bp~15407 bp,与VR-2332、CH-1a、JXA1和NADC30的核苷酸序列同源性为82.9 %~99.4%,14株PRSV-2之间核苷酸序列同源性为82.1%~99.3%,差异较大.分离株FJCH、FJZH与JXA1-R疫苗株高度同源(99.5%~99.6%),且处于同一进化分支,推测其可能来源于疫苗株.重组分析显示14株PRRSV-2存在较高的重组概率(3/14),均发生在lineage 8.7和lineage 1之间.本研究为科学防控福建地区PRRS提供了参考数据.
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