2014年~2016年某大型规模化猪场猪繁殖与 呼吸综合征病毒的遗传演化分析

为研究近年来猪繁殖与呼吸综合征病毒(PRRSV)在规模化猪场的变异情况,本研究对华北某规模化猪场2014年~2016年采集的117份疑似PRRS的病料进行PCR检测,结果阳性病料57份,并对阳性病料中PRRSV的NSP2基因和ORF5基因测序分析.结果显示,43份阳性病料中的PRRSV为NSP2缺失1+29个氨基酸,与HP-PRRSV的缺失相同,其NSP2基因区与HP-PRRSV HuN4株的同源性为93.6%~99.6%;而其余的14份阳性样品中的病毒NSP2则为缺失111+1+19个氨基酸,与PRRSV NADC30株的缺失相同,NSP2基因区同源性为92.3%~92.9%,ORF5基因同源性为93.8%~94.8%.此外,在2016年检测到的4份阳性病料,基于NSP2基因构建的系统进化树显示其属于HP-PRRSV亚群,但基于ORF5基因构建的系统进化树结果显示,这些病毒则与国内近年来在香港、台湾以及华南地区流行的低致病力PRRSV GM2株(谱系3)同源性最高,核苷酸同源性为96.7%~97.0%.以上结果表明2014年以来同一猪场内的PRRSV变异呈多样性,并且出现了两类新的PRRSV变异株.