刚毛柽柳腺苷甲硫氨酸脱羧酶(ThSAMDC)基因的克隆与胁迫下的表达分析

Bulletin of Botanical Research(2018)

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摘要
S-腺苷甲硫氨酸脱羧酶(S-adenosyl-L-methionine decarboxylase,SAMDC)是一种通过参与多胺的代谢途径来调节植物生理生化过程的限速酶.通过分析刚毛柽柳(Tamarix hispida)的转录组数据,获得并克隆了SAMDC基因的cDNA序列,将其命名为ThSAMDC.该cDNA序列全长2 085 bp,包含tiny ORF (tORF)、upstream ORF(uORF)和main ORF(mORF)3个植物SAMDC基因特征ORF.主开放读码框(mORF)长1 107 bp,编码369个氨基酸多肽,相对分子质量为40.34 kD,理论等电点(PI)为4.72.ThSAMDC编码蛋白具有多个较强的亲水性区域,无明显跨膜区.通过与其他多个物种的氨基酸多序列比对结果表明,ThSAMDC具有两个典型的高度保守的结构域:酶原剪切位点(LSESSLF)与蛋白快速降解有关的PEST(TIHVTPEDGFSYAS)结构域.系统发育树结果表明ThSAMDC与菠菜(SoSAMDC)氨基酸序列一致性最高,为77%.实时荧光定量RT-PCR分析显示,ThSAMDC在NaC1、PEG、ABA、CdCl2诱导表达均上调,预示着ThSAMDC可能在刚毛柽柳非生物胁迫应答过程中发挥重要作用.
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关键词
Tamarix hispida,S-adenosylmethionine decarboxylase,stress responses,gene expression
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