基于高通量测序的家用冰箱菌群分析

Practical Preventive Medicine(2020)

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摘要
目的 了解家用冰箱不同环境中的微生物菌群情况,发现潜在致病菌,为人们日常使用冰箱提供一定参考意见.方法 采集7个家庭的家用冰箱4℃、-20℃环境内部及冷凝水共19份样本,通过高通量测序方法检测16s rRNA,分析其菌群情况;并进一步和致病菌数据库进行比对分析,发现潜在致病菌. 结果 共检出30个不同的细菌门,其中变形菌门(74.59%)、厚壁菌门(15.73%)及拟杆菌门(7.80%)含量最高.三种环境中,冷凝水及4℃环境菌群特征比较接近,且G-占比高于-20℃环境.4℃和冷凝水中,假单胞菌属和不动杆菌属分别含量最多,其次为大肠杆菌;而-20℃中,不动杆菌属和巨型球菌数丰度最高.共发现20种潜在致病菌,其中条件致病菌不动杆菌属、假单胞菌属及芽孢杆菌属丰度最高,同时还发现多种食源性致病菌,包括李斯特菌属、沙门菌属及大肠菌属等. 结论 冰箱环境中存在G-为主的多种菌群及潜在致病菌,日常清理冰箱及其重要.
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