南宁市腹泻患儿人星状病毒检测及基因特征分析

目的 了解南宁市腹泻患儿人星状病毒的基因特征.方法 收集2013年南宁市某医院儿科门诊腹泻患儿粪便标本201份,采用实时荧光PCR法进行人星状病毒检测,阳性标本再用PCR方法扩增开放读码框2(open reading frame2,ORF2)部分片段并送测序,通过Blast比对和系统进化树分析序列的基因特征.结果 201份粪便标本中检出6份星状病毒阳性,检出率3. 0％(6/201);其中5株测序成功,经Blast比对显示2株为1型,其余3株分别为2、4和5型,系统进化树分析发现1型均为lineage 1a,2型为lineage 2c,4型为lineage 4a,5型毒株与参考株的同源性为94. 0％～99. 0％,不进行lineage划分.结论 南宁市腹泻患儿存在人星状病毒感染,其基因型呈多样性分布.