2012-2016年北京市朝阳区33株风疹病毒分离株基因特征分析
Disease Surveillance（2019）
摘要
目的 通过对北京市朝阳区疑似风疹病例咽拭子标本进行细胞培养及基因特征分析,了解其分子流行病学特征.方法 使用Vero/SLAM细胞对2012-2016年北京市朝阳区暴发和散发病例的风疹咽拭子标本进行病毒分离,应用反转录-聚合酶链式反应扩增风疹病毒E1基因序列,对扩增产物进行核苷酸序列测定.使用分子生物信息学软件,将获得风疹病毒毒株核酸序列与世界卫生组织推荐风疹病毒13个基因型的32个参考毒株及16株中国部分省市流行株E1基因739个核苷酸序列进行系统发生树的构建及对比分析.结果 共分离出33株风疹病毒毒株,其中8株为1E基因型,25株为2B基因型.1E型风疹流行株分离自2012-2013年,2B型风疹流行株分离自2012-2016.2B型流行株组内遗传距离及组间遗传距离均小于1E型流行株的组内遗传距离和组间遗传距离.结论 2012-2016年北京市朝阳区风疹病毒流行优势株为2B基因型,1E基因型正在逐步被2B基因型代替.2B基因型风疹流行株核酸序列更稳定,并逐渐成为优势基因型.
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