2013-2014年杭州地区季节性A (H3N2)流感病毒PB1基因及其编码蛋白的遗传进化特征研究

目的 分析2013-2014年杭州市季节性A(H3N2)流感病毒PB1基因及其编码蛋白的变异情况,揭示其分子特征与遗传进化趋势.方法 对分离得到的78株流感病毒PB1基因进行扩增和测序,采用序列多重比对、突变位点比较分析和构建进化树等方法进行遗传进化分析.结果 78株流感病毒PB1基因的核苷酸序列和编码蛋白序列一致性分别为97.89％～100.00％和99.08％～ 100.00％,PB]-F2蛋白短肽的序列一致性为44.44％～ 100.00％;PB1蛋白氨基酸序列与参考株A/Texas/50/2012相比,在十多个位点均发生了氨基酸突变,其中V212M、R215K、E331D、A374S氨基酸突变频率较高;PB1-F2蛋白长度分析发现了5种不同的PB1 F2蛋白,其中3种为全长蛋白(90、87、79) aa,2种为截断型PB1-F2蛋白(52,24) aa;构建系统进化树发现78株H3N2毒株PB1基因及其编码蛋白均在同一个支系上,与同期流行季的疫苗株进化关系较近,第三个流行高峰(2014年6～10月)进化关系相对更集中.结论 2013-2014年季节性A (H3N2)流感病毒PB1蛋白氨基酸位点发生了部分重要突变,病毒PB1基因及其编码蛋白的遗传进化以及截断型PB1-F2蛋白的集中出现,可能促使病毒的复制能力和毒力发生变化,并最终导致其流行传播趋势的改变.