一起由诺如病毒GⅠ.5型引起胃肠炎聚集性疫情的分子流行病学分析

Journal of Tropical Medicine(2019)

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摘要
目的 对2018年深圳市龙华区发生的一起由诺如病毒GⅠ.5型引起的胃肠炎聚集性疫情进行分子流行病分析.方法 对诺如病毒GⅠ组核酸阳性的样本进行聚合酶-衣壳区序列测定,同源性和系统进化分析.结果 成功获得3份样本的聚合酶-衣壳区序列,样本编号分别为18JB00186、18JB00187和18JB00190,长度552 bp,核苷酸和氨基酸的同源性为100%,与2018年成都分离株MK121731.1同源性最高,相似度(Per.Ident)99.07%.衣壳区的系统发生树构建分析结果显示,它们属于GⅠ.5进化分支,与2013年济南、2014年上海和2018年成都的部分分离株同属于一个进化分支,为GⅠ.5.1分支.聚合酶区的系统发生树构建分析结果显示,它们属于GⅠ.P4进化分支.结论 应进一步加强辖区诺如病毒不同型别监测,持续关注不常见型别进化情况.
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