基于PCR-DGGE技术分析白木香结香前后内生细菌的变化

Traditional Chinese Drug Research and Clinical Pharmacology(2017)

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摘要
目的 比较结香与未结香白木香内生细菌群落结构及变化,探讨内生细菌在白木香结香过程中的作用.方法 分别提取结香与未结香白木香总DNA,采用细菌16s rDNA通用引物进行扩增,聚合酶链反应-变性梯度凝胶电泳(Polymerase Chain Reaction-Denaturing Gradient Gel Electrophoresis,PCR-DGGE)比较各样品内生细菌群落结构差异,结合样品薄层色谱(TLC)分析,研究活性成分与内生细菌的关联.结果 多食鞘氨醇杆菌Sphingobacterium multivorum在未结香白木香中普遍存在.结香后,内生细菌丰富度和多样性明显增加,PCR-DGGE图谱聚类表明,绝大部分结香样品细菌群态相似性较高,聚在一起;非结香样品间的细菌群态相似性也较高.结论 白木香结香前后内生细菌群落存在明显差异,内生细菌可能参与白木香的结香过程.
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关键词
Aquilaria sinensis(Lour.) Gilg,agarwood,endophytic bacteria,polymerase chain reaction-denaturing gradient gel electrophoresis
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