基于TCGA数据库分析ALAS1在肝癌中的表达及临床意义

目的 基于TCGA数据库分析ALAS1在肝癌中的表达及临床意义.方法 从TCGA数据库中下载肝癌组织和正常肝组织的RNASeq数据以及临床数据和预后数据,分析ALAS1 mRNA在肝癌组织和正常肝组织中的表达差异以及肝癌中ALAS1基因表达水平与临床病理特征及预后的相关性.LinkedOmics数据库分析与ALAS1表达相关的基因.GSEA软件分析预测ALAS1可能的调控信号通路.结果 肝癌组织中ALAS1 mRNA表达水平(12.39±1.20)显著低于正常肝组织(13.93±0.72),差异具有统计学意义(t=8.87,P<0.01).ALAS1 mRNA的表达水平与性别、T分期以及AJCC分期显著相关(χ2分别为31.39、6.86和6.77,P均<0.01),而与年龄、N分期和M分期无相关.生存分析表明,低表达ALAS1患者的生存期显著低于高表达患者.此外,ALAS1表达与POR、SORD、AQP9基因呈显著正相关(r分别为0.70、0.68和0.67,P均<0.01),而与PKM2、VEGFB、PLCB3基因呈显著负相关(r分别为-0.65、-0.60和-0.60,P均<0.01).ALAS1的功能分析显示,低表达样本显著富集到细胞周期、T细胞受体信号通路、GnRH信号通路以及趋化因子信号通路等基因集.结论 ALAS1基因可能作为肝癌临床预后评估的指标以及靶向治疗的新靶点.