北京市腹泻儿童人博卡病毒VP1区基因特征分析

Infectious Disease Information(2019)

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摘要
目的了解北京市5岁以下腹泻儿童人博卡病毒(human bocavirus,HBoV)感染状况及分子流行病学特征.方法收集2015年11月—2016年12月北京市哨点医院5岁以下急性腹泻儿童粪便标本,用巢式PCR对HBoV部分VP1区序列进行扩增,并对阳性序列进行基因特征分析.结果共采集粪便标本396例,检出HBoV 30例(7.58%),包括3种基因型别,分别为HBoV1型(17例)、HBoV2型(11例)、HBoV3型(2例),未检出HBoV4型.进化分析表明,HBoV1序列在进化树上包括两簇,其中,BJ16-325变异程度较大,自成一簇;其他HBoV1序列共同形成一簇.北京地区所有HBoV2序列均位于一个新的HBoV2亚型分支上.结论2015—2016年北京市5岁以下腹泻儿童检出的HBoV包括3种基因型(1~3型);北京市至少存在2组不同来源HBoV1的流行;本地区流行的HBoV2为一种新的亚型.
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