2001-2016年广州市登革3型病毒E基因序列及系统进化树分析

目的 了解2001-2016年广州市登革3型病毒的流行情况,掌握毒株的进化情况和趋势.方法 将登革热确诊病例的血清用荧光PCR检测,阳性血清用C6/36细胞进行病毒分离,测定分离毒株的E基因序列,与NCBI的毒株序列相比较,利用Mega 4.0软件构建系统进化树.结果 2001-2016年共分离到登革3型病毒24株,从基因型上分类属于基因亚型Ⅰ、Ⅱ、Ⅲ和V型,基因亚型Ⅲ在流行年份和分离毒株数上稍占优势.流行病学调查和序列分析均显示与东南亚国家流行的登革热相关度较高.结论 广州市登革3型病毒以输入为主,随着输入压力增大、基因亚型增多和转换,可能会使广州市登革热流行传播更为复杂,流行风险进一步增高.