基于母体血浆单体型分析无创产前检测脊髓性肌肉萎缩症的研究

Journal of Practical Obstetrics and Gynecology(2017)

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摘要
目的:探索无创产前检测(NIPT)脊髓性肌肉萎缩症(SMA)在临床应用的可行性.方法:招募生育过SMA先证者且再次妊娠的24个家系,其家系中夫妻双方及先证者致病突变经多重连接探针扩增技术(MLPA)测定.采集家系外周血及孕11周以后的孕妇血浆,通过目标序列捕获及高通量测序技术,首先对夫妻双方及先证者外周血DNA样品进行目标区域捕获测序,获得与致病位点连锁的亲本单体型信息,再结合血浆测序数据中提供的单核苷酸多态性位点的分析结果,构建隐马尔可夫模型,推断胎儿单体型,从而得到胎儿的基因型.同时利用有创产前诊断MLPA检测验证其准确性.本次研究主要针对SMN1基因第7、8号外显子的检测.结果:24个家系通过NIPT检测检出患胎5例,携带者7例,余12例正常;MLPA检测结果为5例患胎,8例携带者,11例正常.患胎均为SMN1基因第7、8号外显子纯合缺失.NIPT与MLPA检测结果一致率为95.83% (23/24),两种方法诊断结果差异无统计学意义(P =0.317).结论:基于母体血浆目标区域捕获测序、单体型分析NIPT胎儿SMA风险的方法准确、安全,应用于有先证者遗传信息的SMA NIPT有一定可行性.
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关键词
Target region capture sequencing,Haplotype,Spinal muscular dystrophy,Noninvasive prenatal testing,Cell free fetal DNA
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