急性GVHD中Treg细胞相关基因筛选及生物信息学分析

目的：探讨急性移植物抗宿主病（aGVHD）中Treg细胞（调节性T细胞）的基因表达谱变化，为认识aGVHD的发病机制提供新的思路，同时也为早期诊断和治疗寻找潜在重要靶标分子。方法：利用GEO数据库下载aGVHD基因芯片数据，通过差异基因的筛选，GO分析，信号通路分析，最后获得的重要差异基因，并建立相互作用网络。结果：获得显著表达差异基因533个，功能富集分析及信号通路分析提示主要涉及到细胞周期、免疫反应、凋亡过程、细胞因子介导信号通路、同种异体移植物排斥、移植物抗宿主反应等。相互作用网络分析，得到前10个核心节点基因：PIK3R3、IL8、SOCS3、INPP4B、PIP5K1B、CSF2RB、IRS2、MYC、FOS、SOCS2。结论：利用生物信息学的方法，分析aGVHD基因芯片得到参与aGVHD的重要的细胞功能及信号通路，并且寻找到核心节点基因，为认识aGVHD的机制及治疗靶点提供新的思路。