HIV-1整合酶耐药基因型检测方法的建立

Chinese Journal of AIDS & STD(2020)

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摘要
目的 随着整合酶抑制剂的使用,整合酶抑制剂耐药突变出现不可避免,为了更好地预防和控制艾滋病,根据中国1型艾滋病病毒(HIV-1)主要流行株建立HIV-1整合酶基因型耐药检测方法.方法 根据国内HIV主要流行株(CRF01_AE、B、CRF07_BC、CRF08_BC、C)参考序列,用Oligo软件在整合酶保守区设计引物.挑选160例不同病毒亚型、病毒载量>1 000拷贝/mL的样本,进行巢式荧光定量聚合酶链反应核酸扩增和测序.拼接后的序列输入斯坦福大学耐药网站,进行耐药突变位点分析.结果 成功扩增出HIV-1整合酶全长(288个氨基酸),160个样品157个扩增成功(成功率为98.1%).3名操作人员对15个样本进行扩增和测序,核苷酸序列一致性为(99.83±0.05)%.结论 根据中国HIV-1主要流行株建立了整合酶耐药基因型检测方法,有助于优化艾滋病病人抗病毒治疗,有助于HIV-1的防控.
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