西安地区44例水痘-带状疱疹病毒临床分离株基因特征分析

目的 运用分子生物学方法对水痘-带状疱疹病毒株进行基因特征分析,了解西安地区水痘-带状疱疹病毒主要流行的基因型.方法 从临床采集水痘或带状疱疹患者皮肤水疱液标本44份,提取DNA.经过PCR扩增VZV开放读码框(ORF)1,6,12,16,17,21,22,35,37,50,54,55,56,60,66的部分片段,限制性片段长度多态性分析并且产物测序,将测得的序列用MEGA 4软件比对分析,获得分离株的基因型别.结果 从临床采集的44例标本PCR检测水痘-带状疱疹患者皮损标本阳性率为100％,所分离到的水痘-带状疱疹病毒分离株43例为进化枝2,1例为进化枝2和进化枝3的嵌合体.与Oka疫苗株相比,44例患者在SNP 18082位点均发生了T→C的同义突变.结论 西安地区VZV病毒株的基因序列高度保守,进化枝2是优势基因型.研究VZV的基因特征对研究西安地区水痘-带状疱疹分子流行病学有重要意义.