牙周病的表观遗传学分析:生物信息学研究

Tiantian WANG,Xiangqiong LIU, Simin LI

Journal of Modern Stomatology(2019)

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摘要
目的 本生物信息学分析基于牙周炎的高通量RNA测序以及芯片数据,通过整合长链非编码RNA,微小RNA以及信使RNA的表达谱数据,旨在构建参与牙周炎生物学过程的竞争性内源性RNA(ceRNA)网络.方法 搜集到一个微小RNA和三个信使RNA表达谱数据,用来构建长链非编码RNA的竞争性内源性RNA网络.结果 六种基因(HSPA4L,PANK3,YOD1,CTNNBIP1,EVI2B and ITGAL),三种微小RNA(miR-125a-3p,miR-200a,and miR-142-3p),和三种长链非编码RNA(MALAT1,TUG1,FGD5-AS1)参与了牙周炎的竞争性内源性RNA网络.结论 本研究预测出的基因学和表现遗传学的生物标记物可能在牙周炎的发病机制中发挥着至关重要的作用.
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