室间隔缺损患者循环 miRNA 表达差异研究

目的：先天性心脏病（CHD）是环境因素和遗传因素共同作用的结果。室间隔缺损（VSD）是 CHD 中最常见的一种。研究表明，microRNAs（miRNAs）与 CHD 的发生发展关系密切，但目前缺乏有关 miRNAs 与 VSD 的研究报道。本研究旨在通过血清差异 miRNA 的表达研究阐明 miRNA 与 VSD 发生发展的关系。方法采用 miRNA表达谱芯片技术进行 VSD 患者血清 miRNA 表达差异分析，并对结果进行实时定量 PCR（Real-time PCR）验证，进而对 miRNA 调控的靶基因进行生物信息学分析。结果通过 miRNA 芯片在 VSD 患者和对照血清样本中检测 miR-NA 差异表达，筛选出36个表达差异的 miRNA（P ＜0.05），其中21个 miRNA 在 VSD 患者表达显著下调，15个表达显著上调。经过 Real-time PCR 验证，证实8个 miRNAs 差异表达有意义。通过生物信息学预测出447个靶基因，经 GO 分析富集度分值（enrichment score value）最大的生物过程（biological process）为心脏右心室形态发生（cardiac right ventricle morphogenesis），对应的差异表达基因为 NOTCH1、HAND1、ZFPM2和 GATA3，调控这些基因的 miRNA可能包括 hsa-let-7e-5p、hsa-miR-222-3p 和 hsa-miR-433。结论通过微阵列技术分析和 RT-PCR 验证，筛选出8个差异表达 miRNA，为后续实验提供了可供分析的 miRNA。利用3个数据库及 GO 分析，发现 hsa-let-7e-5p、hsa-miR-222-3p 和 hsa-miR-433的靶基因分别为 NOTCH1、HAND1、ZFPM2和 GATA3，为进一步在基因水平研究 VSD 的发病机制提供了新的突破口，为将来可能实现的基因诊断、基因干预治疗以及疾病的预防奠定了一定的实验基础。