头颈部鳞状细胞癌中Klotho基因表达及其甲基化水平与LC3和NSU N2基因表达的相关性

Acta Medicinae Universitatis Scientiae et Technologiae Huazhong(2020)

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摘要
目的 探究头颈部鳞状细胞癌(headand neck squamous cell carcinoma,HNSCC)中Klotho(KL)基因的表达及其启动子区域甲基化水平与自噬基因LC3和RNA甲基转移酶基因NSUN2之间的关系.方法 从癌症基因组图谱(The Cancer Genome Altas,TCGA)数据库中搜集有关HNSCC患者标准化的上四分位转录组测序(RNA-seq V2 RNA-seq by expectation maximization,RSEM)值和KL甲基化的β值(beta-value)信息,采用Kaplan-Meier生存曲线评估KL表达及其启动子区域甲基化与患者存活率之间的关系;采用Spearman相关检测分析KL的表达水平及其启动子区域甲基化水平与LC3和NSUN2表达之间的关系.结果 在HNSCC患者当中,KL表达水平与患者的总生存期呈正相关,而KL启动子区域甲基化水平与总生存期间却有着相反的趋势.且KL高水平表达或其启动子区域低水平甲基化的HNSCC患者往往伴有LC3高表达和NSUN2低表达.结论 在HNSCC患者中,KL表达水平及其启动子区域甲基化水平可作为提示患者预后的一种潜在的生物标志物,且其下游靶点LC3和NSUN2的表达也会受到KL表达的影响.
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