基于显著表达差异三元组识别缺血性心肌病易感基因

目的 基于系统生物学理论和生物信息学方法, 识别缺血性心肌病 (ischemic cardiomyopathy, ICM) 易感基因.方法 从包含缺血性心肌病和正常样本的测序数据获得各样本的mRNA、miRNA和lncRNA的表达数据, 在疾病组和对照组中分别构建显著表达差异三元组, 将其中富集到疾病相关功能类中的差异基因作为疾病候选易感基因.进一步将在疾病相关功能类中且单一和组合均能较好区分疾病和正常样本的候选易感基因作为缺血性心肌病易感基因.结果 结合高通量基因组信息和功能性分析, 识别出了8个缺血性心肌病易感基因, 其所在显著表达差异三元组也能够有效地分类样本.结论识别出的缺血性心肌病易感基因有助于缺血性心肌病的诊断、治疗以及疾病机制的研究.