阿尔兹海默病细胞模型中差异表达lncRNA筛选分析

目的:通过基因测序筛查阿尔兹海默病模型SH-SY5Y细胞中长链非编码RNA(long non-coding RNA,ln-cRNA)的差异表达,发现与AD发病相关的lncRNA,分析其生物学功能.方法:通过Illumina X10基因测序技术检测3组AD模型SH-SY5Y细胞及正常SH-SY5Y细胞中差异表达lncRNA情况,利用GO和KEGG富集分析进一步分析ln-cRNA的功能,确定AD模型SH-SY5Y细胞及正常SH-SY5Y细胞的差异表达谱,Real-time PCR验证部分差异表达lncRNA.结果:差异表达lncRNA共100个,其中40个lncRNA表达上调,60个lncRNA表达下调;GO和KEGG通路分析表明这些差异表达基因主要参与到MAPK信号通路、p53信号通路、细胞周期等信号通路.Real-time PCR验证结果显示7个差异表达的lncRNA上调或下调趋势与测序结果一致.结论:与正常SH-SY5Y细胞相比,AD模型SH-SY5Y细胞中lncRNA的表达水平明显改变,这些lncRNA可能通过某些信号通路参与AD的发生发展,这对进一步寻找诊断和治疗AD的新靶点具有重要意义.