甜瓜VQ家族基因鉴定及白粉病菌响应分析

Journal of Nuclear Agricultural Sciences(2020)

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摘要
VQ家族基因是植物特有的一类基因,其编码蛋白主要与WRKY蛋白相互作用协同调控下游基因表达,在植物生长发育及抵御各种外界环境胁迫中起重要作用.为揭示甜瓜VQ家族基因在抗白粉病中的功能,本研究采用生物信息学方法从甜瓜基因组中鉴定到26个VQ家族基因,这些基因不均匀地分布在甜瓜11条染色体上.系统进化分析表明,该家族成员分布于不同的分支中,分别与拟南芥VQ家族蛋白不同成员聚在一起.基因结构分析表明,甜瓜VQ家族基因序列均无内含子,只有1个外显子.组织表达分析表明,1个甜瓜VQ家族基因组成性表达,23个甜瓜VQ家族基因组织特异性表达.此外,白粉病菌侵染之后,6个VQ家族基因呈现不同程度的响应.本研究结果为进一步研究甜瓜VQ家族基因在甜瓜抗白粉病中的功能奠定了理论基础.
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