湖南烟草病毒病种类检测与系统进化分析

Chinese Tobacco Science(2020)

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摘要
为明确湖南烟草病毒病的种类及分布状况,利用小干扰RNA(siRNA)测序和反转录PCR(RT-PCR)对湖南烟区样品进行检测,分析主要病毒侵染类型,最大似然法构建系统进化树确定分类地位.结果表明,湖南烟草受到烟草普通花叶病毒(Tobacco mosaic virus,TMV)、黄瓜花叶病毒(Cucumber mosaic virus,CMV)、马铃薯Y病毒(Potato virusY,PVY)、番茄斑驳花叶病毒(Tomato mottle mosaic virus,ToMMV)、地黄花叶病毒(Rehmannia mosaic virus,ReMV)和辣椒轻斑驳病毒(Pepper mild mottle virus,PMMV)等6种病毒的侵染,其中ToMMV、ReMV、PMMV首次被检测到,TMV、CMV和PVY是主要病毒,TMV为优势病毒,复合侵染是主要侵染类型,复合侵染率为71.29%;湖南烟草上的TMV分离物形成3个独立组系,CMV分离物属群组I的亚组IB,PVY分离物属PVYNTN-a、PVYE和PVYSYR-I株系.本研究摸清了湖南烟草病毒种类、分布及侵染情况,明确了TMV、CMV、PVY的分类地位,为病毒病的防治提供了理论依据.
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