大豆Glyma.05G222700.2基因生物信息学与逆境表达分析

为研究Glyma.05G222700.2基因编码的丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶在抗非生物胁迫过程的功能和原理,促进大豆抗逆候选基因的开发利用,本研究通过生物信息学方法对大豆Glyma.05G222700.2基因进行同源序列、蛋白结构、进化树和转录组分析,通过qRT-PCR分析盐胁迫下大豆不同组织中该基因的表达情况.结果 表明:该基因编码区长2040 bp,编码697个氨基酸,预测分子量为656.54 kD,pI8.026.多序列比对发现Glyma.05 G222700.2蛋白包含1个Pkinase结构域.进化树分析表明该蛋白与野大豆、刺毛黧豆、赤豆一致性较高.转录组数据表明Glyma.05G222700.2基因在大豆各组织中均有表达,其中在种子中表达量最高,在根中表达量最低.qRT-PCR结果发现Glyma.05G222700.2基因在毛状根、茎、叶中均有表达,在茎中表达量最高,在叶中表达量最低;在毛状根中盐胁迫12 h表达量达到极值,盐胁迫24h表达量下降;在茎中表达量呈上升趋势,在24h表达量达到极值;在叶中表达量不稳定,盐胁迫2h该基因不表达,盐胁迫6h该基因表达量达到极值并高于对照,盐胁迫12和24h表达量低于对照.推断该基因可能在大豆抵抗盐胁迫过程中起到重要作用.