猕猴桃CHI密码子偏好性分析
Fujian Fruits（2016）
摘要
试验以GenBank登录的猕猴桃查尔酮异构酶基因CHI为基础,采用CodonW分析其偏好性,并分别与模式生物基因组进行比较.研究结果发现,猕猴桃CHI有效密码子数为55.93,密码子GG含量和第3位G\C含量分别为0.483和0.525,偏好性较强的密码子有29个,其中AAC、ACC、AGG、CCT和TCT具有极强的偏好性;此外,猕猴桃CHI与模式生物基因组均保持较大的偏好性差异.研究认为,猕猴桃CHI密码子整体偏好性较弱,但对部分特定密码子仍存在选择偏好.研究结果为猕猴桃CHI基因后续研究提供了科学依据.
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