膜果麻黄种子不同发育时期的转录组测序分析

Journal of Northeast Forestry University(2015)

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摘要
以不同萌发期间的膜果麻黄( E.przewalskii)种子为研究对象,应用新一代高通量测序技术平台Illu-mina HiSeqTM 2000对其进行转录组测序和数据重新组装,结果获得了12999122条初始序列,总长为1169920980 bp,初始序列组装获得序列片段的平均长度与N50值分别为351和548 bp;与COG功能注释、GO分类及KEGG代谢通路分析后,获得了49449个GO功能注释、17751个COG功能注释以及16748个KEGG注释;并从KEGG通路中找到有关芪类、二芳基庚烷和姜醇合成途径的编码基因片段230个。
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关键词
Stilbenoid,Ephedra przewalskii,Transcriptome,High throughput sequencing
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