玫瑰转录因子RrMYB10的克隆及表达分析

Journal of Shandong Forestry Science and Technology(2018)

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摘要
R2R3-MYB转录因子在植物花青素合成过程中具有重要作用.本研究基于玫瑰转录组数据,克隆了一个玫瑰花青素相关R2R3-MYB基因,命名为RrMYB 10并对其进行生物信息学分析,期望通过克隆及分析探究MYB基因与玫瑰花瓣成色的关系,为改良玫瑰花色等奠定良好的基础.以‘紫枝’玫瑰(Rosa rugosa‘ Zizhi’)为材料,通过RT-PCR以及RACE技术获得了该基因的cDNA全长.经过生物信息学分析,该基因全长871bp,开放阅读框699bp,编码232个氨基酸,其蛋白的分子式C1230H1904N348O356S6,相对分子质量为27455.13Da,等电点pI为9.01,该蛋白不稳定系数为42.31,属于不稳定蛋白.多重比对及序列分析发现其具MYB的保守域,系统进化树分析表明该基因与同科草莓等亲缘关系最近,与不同科物种亲缘关系远.
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